Monte Sant'Angelo es conocido en todo el mundo por su historia religiosa, convirtiéndose en un destino obligatorio en las peregrinaciones de San Miguel. Santos, emperadores, papas, reyes o simples fieles han venido a arrodillarse ante el altar del Arcángel Miguel.
El centro habitado es el más alto del Gargano (843 m.) y se encuentra en una posición panorámica admirable en un espolón al sur del promontorio, con impresionantes vistas abiertas al oeste en el Tavoliere y al sur en el Golfo de Manfredonia. Sede del Parque Nacional Gargano y Patrimonio de la Humanidad por la UNESCO, la vida de la ciudad se concentra alrededor del Santuario de San Michele Arcangelo, construido entre el siglo V-VI cuando, según la tradición, las apariciones del arcángel habrían ocurrido en una cueva. Los longobardos, que dominaban el sur de Italia en ese momento, lo convirtieron en su santuario nacional. En poco tiempo se convirtió en un centro de renombre en todo el cristianismo y en un destino obligatorio, no solo para los peregrinos de toda Europa, sino también para los cruzados que partían hacia Jerusalén. El área construida tiene una forma alargada alrededor del eje formado por vía Manfredi; esto se vuelve a conectar en el lado oeste de la ciudad a la carretera estatal hacia San Giovanni Rotondo y en el lado oriental a una rama de la carretera estatal Garganica.
El origen del Santuario de San Michele se puede ubicar entre finales del siglo V y principios del siglo VI. Antiguas fuentes escritas dan testimonio de esto: una carta enviada por el Papa Gelasio I en 493/494 a Giusto, obispo de Larino, otra carta del propio Papa a Herculento, obispo de Potenza (492-496) y otra nota informada por Martirologio Geronimiano bajo la fecha del 29 de septiembre. Pero es el "Liber de Apparitione Santi Michaelis" en Monte Gargano, cuya escritura se remonta al siglo VIII, que reconstruye los eventos milagrosos que dieron lugar al culto del Arcángel Miguel en el Gargano de una manera precisa y sugerente. Está vinculado al recuerdo de cuatro apariciones que tuvieron lugar a lo largo de los siglos, que se narran con una vivacidad extraordinaria y emocional y dan testimonio de los milagrosos eventos que ocurrieron aquí.
Ingresado a través del portal románico, nos encontramos dentro de la Basílica, en el lugar elegido por San Miguel. La Iglesia está bien dividida en dos partes: la parte de la entrada construida en mampostería, llamada Navata Angioina y la otra una caverna abierta por la naturaleza en la roca caliza. Tan pronto como entramos, a la derecha, encontramos un pequeño altar, erigido en honor de S. Francesco: recuerda su visita al Santuario, realizada en el lejano 1216. Después de pasar unos pasos el altar de S. Francisco, el visitante abre el cueva, con una bóveda rocosa irregular, que a lo largo de los siglos ha acogido a millones de peregrinos.
La parte más llamativa de los antiguos edificios del santuario son las criptas. Estas habitaciones se remontan a la época longobarda y volvieron a la luz después de las excavaciones en los años 1949-1960. Una vez sirvieron como entrada a la Gruta y fueron definitivamente abandonados en el siglo XIII, en el momento de las construcciones angevinas. Numerosas inscripciones a lo largo de las paredes de las "criptas", algunas con caracteres rúnicos, dan testimonio de la considerable afluencia de peregrinos de toda Europa desde la época lombarda. Las criptas están compuestas por dos habitaciones cuyas estructuras construidas en dos fases se suceden inmediatamente. Algunas inscripciones en las paredes identificadas en 1974 permitieron fechar los edificios entre fines del siglo VII y principios del siglo VIII.
Las criptas, de unos 60 metros de largo, se desarrollan justo debajo del piso de la Basílica. La primera parte de ellos tiene la forma de una galería porticada, dividida en ocho bahías rectangulares. En este ambiente evocador, se han exhibido varias esculturas de las excavaciones del santuario, de la antigua iglesia de S. Pietro y de las ruinas de la abadía benedictina de S. Maria di Pulsano. Todas las exhibiciones aquí son datables desde el siglo VII hasta el siglo XV. Al atravesar la abertura excavada en el muro de contención, nos encontramos en el otro entorno de la era longobarda, (con huellas evidentes de las construcciones prelongobardas) divididas en dos grandes naves.
Estas habitaciones se separaron definitivamente de la Sacra Grotta alrededor de los años 1270-1275, cuando los Angevinos, con los nuevos edificios, le dieron al Santuario su diseño actual, sacrificando las obras anteriores erigidas en honor de San Michele Arcangelo.
En noviembre de 1989 se abrió el museo devocional, que se encuentra en las habitaciones adyacentes a un local de objetos de recuerdo. El propósito del museo es recolectar y mostrar a los visitantes los diversos objetos que dan testimonio del culto a San Michele Arcangelo. La mayoría de estos son regalos ofrecidos al Santuario por los peregrinos a lo largo de su historia secular, como un signo de agradecimiento por las gracias recibidas. Los objetos se exhiben en el corredor y en cuatro salas que conforman los espacios del museo.
